Le Groupement d’Intérêt Public (GIP) Réserve Nationale Marine de la Réunion est l’instance gestionnaire de La Réserve Marine. Le conseil d’administration du GIP est une instance décisionnelle, à l’inverse des autres instances qui sont consultatives. Il prend les grandes décisions relatives à la gestion de la Réserve marine : budget, orientations stratégiques, recrutement du directeur…
Il se réunit plusieurs fois par an sous la présidence du Préfet ou de son représentant. Les membres du GIP contribuent financièrement à la gestion du GIP.
Le Conseil d’administration est composé de représentants des services de l’Etat (Préfet, DEAL) du Conseil Régional (qui en assure la vice-Présidence), du Conseil Général, des communes de Saint-Paul, Trois Bassins, Saint Leu, de l’intercommunalité TCO (Territoire de la côte Ouest), du Parc National de La Réunion, du représentant des usagers, du représentant du personnel du GIP.